復旦大學附屬腫瘤醫院是國內歷史悠久、享有盛譽的腫瘤專科醫院，其前身是中比鐳錠治療院，于1931年3月1日正式成立，至今已有七十八年的歷史，是我國成立最早的腫瘤專科醫院。
目前，有教職員工1300人，其中專業技術人員800人；正、副教授139人；博士生導師24人，碩士生導師52人。劉泰福教授為美國放射學院院士、歐洲放射學會榮譽委員，蔣國梁院長為美國放射學院院士。
設有頭頸外科、乳腺外科、胸外科、胃及軟組織外科、大腸外科、泌尿外科、婦科、化療科、放射治療科、中西醫結合科、胰腺肝膽外科、綜合治療科、麻醉科、放射診斷科、檢驗科、藥劑科、內窺鏡科、病理科、超聲診斷科、核醫學科、實驗研究中心等臨床及醫技科室。有核定床位800張，實際開放床位1064張。2009年門急診量59.2萬人次、住院人數2.25萬人次、手術例數1.44萬人次、放療病人4800人次。
復旦大學附屬腫瘤醫院擁有腫瘤學國家重點學科，設有腫瘤學博士點和博士后流動站。近年來，醫院科研教學碩果累累，2004年，由邵志敏教授領銜的課題《乳腺癌的基礎與臨床》獲國家科技進步二等獎。2009年共招收碩士研究生44名，博士研究生23名；畢業碩士畢業生40名，博士研究生20名。在讀博士生68名，碩士生116名，博士后2名。發表論文165篇，其中SCI論文82篇，核心期刊65篇；出版專著7部；獲1項發明專利；獲上海市醫學科技進步獎二等獎1項，中華醫學科技獎三等獎1項。
擁有國家教育部重點學科1個（腫瘤學），衛生部臨床重點學科2個（乳腺癌、病理學），上海市臨床醫學中心2個（放射治療、乳腺癌），上海市醫學重點學科1個（臨床病理學），復旦大學重中之重建設學科4個（乳腺癌、放射治療、病理學、大腸癌）。醫院為上海市病理、放射治療、腫瘤化療3個質量控制中心以及上海市抗癌協會的掛靠單位，設有國家食品藥品監督管理局認定的國家藥物臨床試驗機構，以及復旦大學腫瘤研究所、復旦大學乳腺癌研究所、復旦大學大腸癌診治中心、復旦大學鼻咽癌診治中心、復旦大學附屬腫瘤醫院肺癌防治中心等科研機構。主辦《中國癌癥雜志》和《上海醫學影像雜志》2本學術期刊，以及《抗癌》科普雜志。
為提升醫院的醫療和學科建設水平，推廣腫瘤疾病的先進診療理念，貫徹腫瘤疾病的診療指南，于2005年6月成立了包括肺癌和食管癌、乳腺癌、胃癌、大腸癌、淋巴瘤、鼻咽癌、甲狀腺癌、頭頸惡性腫瘤、前列腺癌、婦科腫瘤、胰腺肝膽惡性腫瘤、骨和軟組織腫瘤等12個多學科綜合治療協作組，這是一個以病人為中心，以完善治療為目的的系統化工程，各協作組分別有一位召集人，并由腫瘤外科、腫瘤內科、放療科、腫瘤病理科、放射診斷科、核醫學科、超聲診斷科的教授共同參與討論每個患者的診治方案，力爭使患者接受最正規的系統化治療，提高腫瘤患者的療效。
復旦大學附屬腫瘤醫院不斷拓展對外交流領域，擴大國內醫療服務覆蓋范圍。在浙江溫嶺市第二人民醫院掛牌成立復旦大學附屬腫瘤醫院臺州分院。受閔行區政府和閔行區衛生局委托，對閔行區腫瘤醫院進行全面管理，成立復旦大學附屬腫瘤醫院閔行分院。醫院期望通過分院的建設逐步將腫瘤治療的先進理念推向華東地區乃至全國，為更多的腫瘤患者提供高質量的醫療服務。
2003年9月，醫院與美國德州安德森腫瘤中心（M.D.AndersonCancerCenter）正式簽署協議締結為“姐妹醫院”，建立腫瘤病人遠程會診機制，為腫瘤病人提供接受國外著名醫療機構治療的途徑。2005年9月，與新加坡國立健保集團癌癥中心簽訂合約，正式締結為“姐妹醫院”，合作進行腫瘤基礎研究和臨床經驗的交流，同時建立腫瘤病人的互相轉診機制。2008年4月，與法國Gustave-Roussy腫瘤中心正式簽署合作協議，締結為“姐妹醫院”，進行課題申請和人才培養等方面的合作。
外事接待工作完成出色，秉著外事無小事的原則，歷年來接待了來自美國、英國、德國、法國、日本、新加坡等國家和地區的專家，與醫院進行學術報告、課題合作、人才培養等各方面的交流與合作。2005年6月10日，比利時王后保拉在部分比利時大學校長、教授的陪同下訪問腫瘤醫院，同時保拉王后為“百萬婦女乳腺普查工程”揭牌。2006年6月16日，摩洛哥國王夫人拉拉?薩爾瑪公主訪問腫瘤醫院，在全院共同努力下，圓滿完成接待任務。
2009年，先后主辦國際學術會議9次，包括第四屆中德放射腫瘤學研討會、中日細胞動態可視化研究會、中-法胃腸間質瘤靶向治療高峰論壇、2009年CSCO上海臨床腫瘤治療新進展論壇―分子靶向治療會議、中意婦產科超聲學校中國學習班、2009臨床放射生物學基礎培訓班、第三屆復旦-MDACC診斷病理新進展研討會、第十屆全國乳腺癌會議暨第四屆上海國際乳腺癌論壇、2009中美大腸癌多學科綜合治療研討會。國際會議的圓滿召開對于促進醫院的國際交流合作，擴大國際影響等方面，起到了很大的促進提升作用。
貫徹響應衛生部“以病人為中心，以提高醫療服務質量為主題”的醫院管理年活動要求，不斷強化醫院管理，從提高信息化程度、規范收費、縮短就醫流程、落實便民利民措施等方面入手，進一步縮短病人就醫等候時間，認真研究解決病人“看病難、看病貴”等問題，促進醫院內涵建設，進一步提高醫療服務質量，提高病人滿意度，并結合社會主義榮辱觀教育，全面開展“治理醫藥購銷領域商業賄賂”專項工作，推進精神文明建設，探索建立醫院規范管理和績效評價的長效機制。
復旦大學附屬腫瘤醫院新建門急診醫技綜合樓工程為上海市市政重點工程的配套項目，隨著腫瘤醫院“十一五”基建規劃的進程推進，2006年9月18日新建門診大樓正式啟用，為來院就診病人提供舒適溫馨的就診環境和更為優質的醫療服務。2009年3月23日，門急診綜合樓南樓正式啟用，該大樓內包括靜脈藥物配置中心、實驗研究中心、病理科、組織庫等部門，為醫院的基礎研究工作提供了先進的科研建設平臺。