上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心（簡稱“兒中心”）是由上海市人民政府與世界健康基金會（ProjectHOPE）合作共建的一所集醫、教、研于一體的三級甲等兒童專科醫院。1998年6月1日醫院正式開張，前國家主席江澤民同志為醫院題寫院名，美國前總統夫人希拉里·克林頓女士為醫院開張剪彩，2011年，美國新任駐華大使駱家輝先生到訪醫院，將兒中心譽為“中美醫學成功合作典范”。
　　醫院占地面積100畝，總建筑面積約8.4萬平方米，規模床位1000張，實際開放床位604張，重癥監護床位數配置占總數的1/5。目前，年門急診總量約140萬人次，出院病人約2.2萬人次，手術病人約1.3萬人次，門急診、日間手術0.7萬人次。2010年，兒中心成為國內首家通過JCI國際醫院認證的兒童專科醫院。2012年，醫院獲得國家藥物臨床試驗機構資格認定證書，共8個專業獲得藥物臨床試驗專業資格。此外，醫院擁有多個在國內外具有重要影響力的優勢特色學科。心臟中心是國內建立最早、全球規模最大的小兒先心病診治中心。心臟手術量每年逾3500例，其中復雜、疑難先心病大于55%;，手術成功率在97%;以上，手術最小年齡為生后6小時，最輕體重800g；心導管術1400余例。在國內率先開展大血管調轉術、先心病合并氣道狹窄根治術、雙調轉手術、兒童永久起搏器植入術以及胎兒心血管超聲、核磁共振檢查等多項新技術并在全國推廣。兒童血液腫瘤中心已成為國內規模最大的診治中心，每年收治新發白血病及腫瘤病例450余例，累計完成各類疑難重癥的造血干細胞移植近500例，兒童急性淋巴細胞性白血病5年無病生存率大于75%;，再生障礙性貧血移植總體成功率為91%;，達到發達國家先進水平。兒童保健（發育行為兒科）專業是我國該學科領域的發源地之一，近年來學科在注意缺陷多動癥、孤獨癥等發育行為兒科疾病率先進行了醫教結合干預模式，同時團隊在鉛中毒、新生兒聽力篩查和兒童睡眠健康項目中有效實現了科學研究向公共衛生政策的轉化，獲得了三項國家科技進步二等獎，同時得到了國際同行的高度認可。
　　醫院作為上海交通大學醫學院的附屬醫院，兒科學專業已經成為國家重點學科、211工程、985工程、085工程重點建設學科，相關兒科亞專業相繼獲得國家臨床重點專科、衛生部重點實驗室、衛生部首批小兒先天性心臟病診斷和介入治療繼續教學的培訓基地、上海市首批臨床醫學中心、上海市醫學重點學科及上海市公共衛生重點學科等。醫院還設有國內首家兒科轉化醫學研究所、上海市小兒先心病研究所，以及兒童聽力、兒童血液腫瘤、注意力缺陷、呼吸循環、小兒肝病、兒童癲癇、兒童睡眠障礙等多個研究所及臨床診治中心。15年來，先后獲得國家科技進步二等獎5項（合作2項），多次獲得上海市科技進步一等獎、中華醫學會科技進步獎、教育部科技進步獎、宋慶齡兒科醫學獎等重大科研獎勵。近年來，醫院引進并培養了一批學科骨干，獲得中央千人計劃、上海市千人計劃、國家優青、東方學者、衛生系統領軍人才等各類人才資助計劃。醫院設有兒科專業博士后流動站、博士、碩士培養點，也是上海市兒科住院醫師規范化培訓的主要基地之一。
　　醫院先后與30余個國家和地區的醫療機構，包括與23個世界最具影響力的兒童醫院建立了友好合作關系。此外，醫院秉著“培訓—培訓者”的理念，連續十年開展“西部及東北地區兒科醫護人員培訓項目”，免費為西部及東北部邊遠地區18個省、53個城市培養了273名兒科人才。醫院在國內率先設立醫務社會工作部，建院以來共有近萬名患者獲得資助和治療。