廣東三九腦科醫(yī)院是國務院國資委全資建設的現代化三級甲等腦專科醫(yī)療機構。1994年經國家衛(wèi)生部批準設立。實際展開床位800張。國內著名神經內（外）科專家學者吳若秋、李齡、譚啟富、許建平、唐剛揆、尹普安、王象昌、成良正、田新良，中醫(yī)專家歐陽群等在不同的歷史發(fā)展時期直接參與了醫(yī)院臨床醫(yī)療和科研工作。著名癲癇內科專家沈鼎烈教授、神經內科專家田時雨教授、神經外科專家黃勤教授，作為醫(yī)院首席專家常年領綱主持相關學科建設。原全國人大副委員長吳階平、原國家衛(wèi)生部部長陳敏章為醫(yī)院題寫了“勇攀醫(yī)學科學高峰，不斷提高診治水平”、“發(fā)揮專科優(yōu)勢，爭創(chuàng)一流技術”，對醫(yī)院建設取得的成績予以贊揚和勉勵。　　目前醫(yī)院設有41個臨床診療和功能檢查科室。擁有國內第一臺美國4D公司生產的價值2500萬元腦磁圖大腦功能與定位檢測儀、日本光電公司出品的超大陣列37臺最新高分辨率視頻腦電監(jiān)測系統(tǒng)，飛利浦公司1.5T及GE3.0T功能磁共振儀和64排128層全身CT、移動CT、諾華刀（美國瓦里安直線加速器和德國博醫(yī)來定位系統(tǒng)）、適形調強精準放療系統(tǒng)、美國GE彩色超聲診斷儀、平衡治療儀與耳右復位轉椅、法國ROSA手術機器人，德國博醫(yī)來手術導航系統(tǒng)、7臺（套）世界最先進的神經外科手術顯微鏡和麻醉機、唿吸機、監(jiān)護儀、美國產新型接觸式半導體激光刀、術中超聲，擁有國內先進的手術室環(huán)境和配套設備，重癥監(jiān)護病房技術條件優(yōu)良，醫(yī)院設備總值逾4億元人民幣。　　醫(yī)院擁有國內先進、華南地區(qū)領先水平的癲癇診療中心（由癲癇內科、癲癇外科及電生理監(jiān)測中心組成）；腦部腫瘤外科、放療與化療；腦血管病的內科、外科、介入；小兒神經系統(tǒng)疾病的內、外科治療；以手術為特色的腦癱綜合康復治療；系列難治性精神病的綜合治療和植物狀態(tài)促醒等一批極具專業(yè)特色優(yōu)勢的學科群，強大的神經外科由腫瘤神經外科、顱底神經外科、小兒神經外科、綜合神經外科、微侵襲神經外科、血管神經外科、癲癇神經外科等7個學科組成，廣東省頭痛診療中心、眩暈診療中心、腦血管病內科診療中心、神經系統(tǒng)感染和變性疾病診療中心、小兒神經內科、腦癱診療中心、神經康復診療中心、心理行為疾病診療中心、睡眠醫(yī)學診療中心、兒童神經腫瘤中心、神經電生理中心（含腦磁圖等）等學科在國內和東南亞地區(qū)形成了重要的影響和知名度，受到國內外同行和患者的肯定。　　牽頭成立了廣東省華南癲癇與腦科學研究所，擬從事腦疾病基礎和臨床研究。醫(yī)院現為中國抗癲癇協會立體定向腦電圖與腦定位學專業(yè)委員會、廣東省心理學會臨床心理專業(yè)委員會、廣東省康復醫(yī)學會重癥康復分會等學會主委單位。　　多年來，醫(yī)院堅持“更專業(yè)、更有效、更經濟”核心價值觀，在廣東省民情調查調研機構的患者滿意度調查中，位列全省三甲專科醫(yī)院第二名，省直屬醫(yī)療機構“新農合”病人就診量第三、農民自費比例最低，省行風評議先進單位。醫(yī)院發(fā)自內心地用行動理解和尊重患者、主動承擔國有企業(yè)社會責任的實踐，受到了社會各界特別是患者的高度認同。