蚌埠市傳染病醫院始建于1953年，是省內建院最早、規模最大的市級傳染病專科醫院，在皖北乃至整個淮海經濟區治療35種國家法定傳染病專科醫院中，占有十分重要地位。醫院設有肝科、肺科、急性傳染病科、皮膚、性病科，同時，蚌埠市還將結核病防治所、皮膚性病診療中心、中西醫結合肝病研究所、肝硬化研究所設在該院，使科研和臨床治療緊密地結合在一起。
蚌埠市傳染病醫院現有高級技術人員14名，中級技術人員54名，在讀研究生2名，在診治各型肝炎、肝硬化、肺結核、流腦、乙腦、狂犬病、傷寒、各種性病和疑難傳染病，特別是在治療重癥肝炎、肝硬化、小兒肝炎、難治性肺結核、性病等方面有獨特療法，肝炎、肺結核治愈率、危重病人搶救成功率達到國內先進水平。
96年以來，醫院先后選派20多名優秀中青年醫務人員赴北京解放軍302醫院、上海瑞金醫院、上海皮膚性病研究所、浙醫大附院、安醫附院等省、部級醫療單位進修學習，同時，投入數百萬元購置了全自動生化分析儀、血液透析儀、腹水超濾機等檢測和治療設備。開展了肝硬化的藥物研究、乙肝抗病毒組合藥物臨床對照研究、脂肪肝降脂方劑遴選應用以及人工肝支持系統治療重癥肝炎等科研項目，其中人工肝支持療法治療重癥肝炎填補了安徽省空白，使重癥肝炎患者治愈率大大提高。
蚌埠市傳染病醫院投資2600萬元，新建了建筑面積達15200m2的現代化病房大樓及輔助設施，現已投入使用，新大樓可容納病床330張，病房內設有中央空調、中央供氧、中央吸痰、電視、電話、傳呼對講、壁櫥、衛生間、淋浴等，各項設施齊全。我們將以低廉的價格、一流的技術全方位地為患者提供更加優質的服務。