福建省軍區機關醫院創建于1956年，承擔著福建省軍區全體將士及家屬的健康保障工作，為福建省市醫保定點單位，福建省征兵體檢定點單位。醫院擔負著醫療、教學、科研、預防保健、康復和信息研究等任務，負責全軍疑難病的會診、轉診和收治的診療工作。醫院向全社會開放，竭誠為患者服務。醫院科室齊全，實力雄厚。其中，泌尿結石治療中心為福建省軍區機關醫院重點學科；保健科、風濕科專業為醫院特色專業；外科、內科、五官科、口腔科、皮膚科、理療科為優先發展學科。堅持以“立足部隊，服務社會”為發展方向，全心全意為部隊和地方百姓提供優質的服務。技術力量雄厚醫院每年派出技術骨干到各軍地醫院學習交流，不斷進取、積極探索與國際接軌的各項前沿醫療技術，并與國內外眾多知名醫療機構進行了廣泛的學術交流和技術協作，吸取診療技術精華，集微創無痛治療、高科技術物理治療、康復支持治療融為一體，其生殖保健、臨床診斷、治療水平在福建地區均名列前茅。