武漢市婦幼保健院于2003年9月成立，由武漢市兒童醫院和武漢市婦幼保健院組成。武漢市兒童醫院和武漢市婦幼保健院分別始建于1954年和1992年。中心擔負著全省及鄰近地區兒童疾病的醫療、科研任務和武漢市近500萬婦女兒童的衛生保健及其管理、指導任務。武漢市婦幼保健院占地面積共6.55萬平方米，擁有三個門診部和一幢10層、二幢3層共600張病床的現代化病房大樓。中心還將在近年內興建1.6萬平方米的婦幼保健大樓和2萬平方米的外科綜合大樓。病區內設中央空調、中心負壓吸引、中心供氧系統，建有ICU、NICU、CCU等重癥監護單元和急救網絡系統。武漢市婦幼保健院在編職工1144人，其中具有高級職稱人員193人；是武漢大學、華中科技大學同濟醫學院、河南新鄉醫學院的教學基地，有兼職教授35人，每年擔負著本科、大專、中專及進修計1000余名醫學生的臨床教學和實習任務；中心還設有武漢市衛生學校分校，為兒科護理培養專門人才。武漢市婦幼保健院專科設置齊全，有小兒內、外、眼、耳鼻咽喉、皮膚、急救、中西醫結合、中醫、外科日間手術、婦產科等臨床科室及兒童保健科、婦女保健科、基層指導科等預防保健科室，設有藥劑、檢驗、放射、超聲、內窺鏡等十余個醫技科室。配備有全身螺旋CT、核磁共振、1250毫安X光機、數字成影血管造影機、人工呼吸機、全自動生化分析儀、全自動細菌培養系統、動態腦電圖、高壓氧艙等大、中型醫療儀器。武漢市婦幼保健院著力發展重點專（學）科，小兒心胸外科、生殖健康科為市級重點專（學）科，小兒耳鼻咽喉科、小兒神經內科、小兒腹腔鏡專科、小兒CT與MRI影像診斷科、醫學分子生物學與免疫學是市級重點專（學）科建設單位。1999年經湖北省衛生廳批準，“湖北省兒童心血管疾病診療中心”在市兒童醫院成立。中心還建立了小兒氣管異物治療中心、小兒哮喘病診療中心、小兒日間手術治療中心、小兒腎病治療中心、小兒微創及腹腔鏡外科診療中心。投入了一定的人力物力，為發展專科專病優勢創造條件，使其治療水平進一步提高。武漢市婦幼保健院在全市建立了輻射13個區1028個社區的三級婦幼保健服務網絡和婦女兒童疾病監測網絡，在全國率先開展了婚檢人群艾滋病篩查，并在全市廣泛開展了新生兒疾病篩查，產前唐氏綜合癥篩查工作，為提高全市出生人口素質，提高婦女兒童生存質量做了卓有成效的工作。近十年來，武漢市婦幼保健院已通過科研成果鑒定37項，分別達到、接近國際先進水平及國內領先水平，獲得武漢市科技進步獎19項，湖北省科技進步獎1項，湖北省醫學衛生科技進步獎5項；在國內外各專業期刊發表論文1290余篇。隨著對外交流的擴大，武漢市婦幼保健院先后與加拿大魁北克拉瓦爾大學中心醫院和英國曼城圣瑪莉醫院結為友好醫院，與德國杜伊斯堡市心血管疾病治療中心定期開展學術交流活動。質量是中心管理永恒的主題，武漢市婦幼保健院十分注重質量管理，建立了綜合質量管理體系，制定了三級醫師查房、單病種質控、疑難病考核、專科護理和整體護理質量標準，堅持質量考核獎懲制度。同時，還制定了44個崗位服務標準，在中心推行規范化服務。通過提高醫療質量和服務質量，贏得了病人的信賴。武漢市婦幼保健院曾多次被評為全國和省、市衛生系統“文明單位”，被衛生部授予“全國衛生文明先進集體”等榮譽稱號，連續三年榮膺武漢市十行業新風杯競賽的“白求恩新風杯”。1996年市兒童醫院被湖北省衛生廳評定為全省專科醫院中的首家“三級甲等醫院”，1998年被湖北省衛生廳授予“湖北省文明行業示范醫院”榮譽稱號，并于同年跨入全國“百佳醫院”行列。武漢市婦幼保健院被衛生部確定為中國兒童衛生保健指導中心，被授予“愛嬰醫院”稱號。2004年，中心被市文明委、市衛生局確定為武漢地區第一批文明品牌醫院。