中國醫(yī)科大學口腔系成立于1985年，附屬口腔醫(yī)院創(chuàng)建于1987年，1998年成立口腔醫(yī)學院。2004年9月集醫(yī)療、教學、科研于一體的10層綜合樓建成并投入使用，建筑面積12000平方米，位于沈陽市中心地區(qū)的中山廣場北側(cè)。醫(yī)院設有門診、急診及病房，現(xiàn)代化的內(nèi)部設施，如中央空調(diào)、HIS醫(yī)院管理網(wǎng)絡、醫(yī)患呼叫系統(tǒng)、層流手術室等配套齊全。醫(yī)院目前有12個教研室、9個臨床科室、7個醫(yī)技科室及中心實驗室。全院現(xiàn)有教職員工306人，其中，碩、博士占師資總數(shù)的88%。門診綜合治療椅108張，病床70張。日門診量600余人次。2004年在原有學科的基礎上，經(jīng)學校和省衛(wèi)生廳的批準，先后正式成立了整形外科及整形美容中心、口腔頜面腫瘤治療中心、口腔種植中心、干診科等四個學科。2005年6月成立了急診科，都取得了良好的社會效益和經(jīng)濟效益。
中國醫(yī)科大學附屬口腔醫(yī)院是沈陽市、遼寧省乃至東北三省的口腔疑難病癥診療中心。同時還承擔著遼寧省老干部口腔醫(yī)療保健任務。遼寧省口腔醫(yī)學會、遼寧省牙病防治指導組、沈陽醫(yī)師協(xié)會口腔專科分會掛靠在我院。2005年醫(yī)院首次進入遼寧省衛(wèi)生廳目標管理達標單位，并被評為“遼寧省衛(wèi)生系統(tǒng)誠信服務先進單位”。我院被國際“微笑列車”、中華慈善總會確定為“微笑列車唇腭裂矯治項目”定點醫(yī)院。從2005年3月起，已診治唇腭裂患者350余人次，為社會做出了較大貢獻，同時也增強了醫(yī)務人員的社會責任感。被中華慈善總會評為“中華慈善獎”。我院于2005年1月被批準為沈陽市基本醫(yī)療保險定點醫(yī)院。一年多來，我院積極創(chuàng)建醫(yī)療保險患者的就醫(yī)環(huán)境，建立健全醫(yī)療保險管理制度，獲得沈陽市醫(yī)療保險管理工作先進單位。沈陽鐵路醫(yī)療保險定點醫(yī)院也于2006年12月1日正式開通。
醫(yī)院擁有先進的醫(yī)療檢查設備，如德國進口根管顯微鏡、牙周內(nèi)窺鏡系統(tǒng)、數(shù)字全景X光機、超聲骨刀、手術顯微鏡、擺動鋸、顳下關節(jié)鏡及等離子手術系統(tǒng)等。近三年共開展“三新”項目81項。我院在國內(nèi)較早開展口腔及頭頸腫瘤的綜合治療、唇腭裂序列治療，復雜頜骨骨折等頜面部重癥創(chuàng)傷的救治及顱頜面畸形整復、正頜外科等，應用顯微外科技術行各類組織缺損的修復及器官再造，在國內(nèi)較早開展口內(nèi)進路的髁狀突骨折內(nèi)固定術，在沈陽市獨家開展根管顯微鏡的應用，機用鎳鈦抗扭力馬達用于根管預備，熱力膠垂直加壓填充系統(tǒng)，開展牙周序列治療SPT、GTR、GBR、牙周微創(chuàng)治療及牙周美容手術，應用牙周超聲綜合治療機、Florida探針牙周自動檢測系統(tǒng)、顯微牙周外科手術器械、牙周內(nèi)窺鏡系統(tǒng)等進行重度疑難牙周疾病的診治。普遍開展各種精密附著體義齒、全瓷，使用鈦合金、金合金鑄造義齒支架或全口義齒的部分基托，應用超聲骨刀行上頜竇提升術、引導骨再生術等新方法，種植牙的數(shù)量和質(zhì)量不斷提高。應用最新技術矯治各類錯牙合畸形等。2006年，我院被中華口腔醫(yī)學會確定為國家臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師口腔頜面外科培訓基地。
中國醫(yī)科大學口腔醫(yī)學院是培養(yǎng)口腔醫(yī)學高級人才的搖籃，是口腔臨床醫(yī)學博士學位及口腔醫(yī)學碩士學位授予權學科單位。現(xiàn)有博士生導師10人，碩士生導師45人。二十年來培養(yǎng)（包括在讀）本科生1150人，碩士457人，博士79人。近五年，獲國家及國務院各部門科研項目7項、國家自然基金項目6項、省、部級基金項目68項、市級基金項目12項，總計93項，在各級專業(yè)雜志發(fā)表論文501篇。我院有27人分別擔任中華醫(yī)學會、中華口腔醫(yī)學會專業(yè)委員會常務委員、委員、學組成員，84人次在各類學術刊物分別擔任主編、副主編、常務編委、編委。為加強口腔醫(yī)學院學科建設，挖掘優(yōu)秀科技人才和鼓勵青年科技人員的科研創(chuàng)新，2006年開始設立院級青年科研啟動基金，每年資助約4-5項。
2006年4月藥物臨床試驗基地通過國家食品藥品監(jiān)督管理局藥品認證管理中心實地認證評估，2008年9月正式獲得藥物臨床試驗機構資格。醫(yī)院還十分重視學術交往與交流。五年來，特別是近兩年醫(yī)院選拔5名技術骨干到北京、上海等國內(nèi)名牌院校進修學習。我院目前已與美國、日本、韓國等國建立了經(jīng)常性的學術往來關系。每年請外國專家來院講座10余次。已有70余人到美國、日本等國家深造和訪問。2006年10月，我院成功舉辦了第七屆全國口腔病理學會，包括來自日本、臺灣的多名知名專家進行了精彩的講座。