四平市傳染病醫院始建于1972年，占地面積1.8萬平方米，職工400余人，編制床位300張；設有中西醫結合療區、慢性肝炎療區、重癥肝炎療區、肝硬化、肝癌療區、非病毒性肝炎療區、感染性疾病療區、綜合治療科、皮膚、性病科以及醫技職能部門33個；主要承擔四平及周邊地區的傳染病收治、傳染病疑難重癥會診以及應對突發公共衛生事件的應急救治任務，是四平地區唯一一所具有收治各種國家法定傳染病資質（結核病外）的定點醫保、農合直報單位，是集醫療、科研、預防于一體的多功能二級甲等專科醫院，曾出色的完成了全市“甲肝”、“流行性腹瀉”、“流腦”、“非典”、“甲流”、“手足口病”等多起大型突發公共衛生事件的救治任務。
醫院擁有300多名從事傳染病臨床的專業技術人員，薈萃了一批肝病及傳染病學科帶頭人和名醫。醫院常年派出醫療骨干到上級醫院進修，北京解放軍302醫院、吉大一院專家每月定期來院出診，具有一整套科學、系統、規范的傳染病治療體系。尤其在肝病診治方面，緊跟國內外先進的肝病診療技術，采取抗病毒、保肝、免疫調節、阻斷肝纖維化等多種手段，取得了滿意的療效，在肝炎、肝硬化、肝癌、肝衰竭、艾滋病、各種感染性疾病等傳染性疑難病癥的診治及研究方面在四平地區具有權威地位。
醫院擁有日本東芝螺旋CT、肝纖維化診斷儀、多普勒超聲診斷儀、電子胃鏡、法國ABX全自動血液分析儀、全自動血凝儀、日本1200速全自動生化分析儀、上海時間分辨熒光免疫分析系統、生化微量檢測儀、全自動尿沉渣分析系統，全自動血球計數儀、芬蘭MK2酶標儀等大型醫療設備百余臺，開展檢驗項目300多項；結腸途徑治療機、腹水環注技術對肝性腦病、肝硬化腹水療效確切；近期開展的肝纖維化診斷技術躋身全國先進行列。醫院環境優雅溫馨，空調式移動空氣消毒機、一床一套式床單位消毒機等設施，為避免院內交叉感染，提供了保障。
傳染病醫院是“國家中醫藥防治傳染病臨床基地建設單位”、“國家中醫藥管理局第三批中醫藥防治傳染病臨床基地”、“國家中醫藥管理局中醫藥免費治療艾滋病項目單位”、“基礎慢乙肝培訓基地”、“四平市肝病健康公益檢查中心”；“北京佑安醫療聯盟四平醫院”、“解放軍第三0二醫院協作醫院”、“吉林大學第一臨床醫院傳染病學科項目建設協作單位”。多年來被吉林省委、省政府授予“吉林省精神文明建設先進單位”，被省衛生廳授予“吉林省行業作風建設先進單位”，被市衛生局授予“先進黨委”、“先進單位”，檢驗科、綜合治療科被吉林省衛生廳授予“巾幗文明示范崗”。